Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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RABGEF1Q9UJ41 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RABGEF1Q9UJ41 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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RABGEF1Q9UJ41 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1Q9UJ41 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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