Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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USP35Q9P2H5 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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USP35Q9P2H5 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP35Q9P2H5 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP35Q9P2H5 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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