Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
BBS9Q3SYG4 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BBS9Q3SYG4 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BBS9Q3SYG4 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.9 ms