Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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