Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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NPRL3Q12980 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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NPRL3Q12980 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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NPRL3Q12980 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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NPRL3Q12980 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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NPRL3Q12980 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPRL3Q12980 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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