Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRBP23467 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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