Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC74AQ96AQ1 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC74AQ96AQ1 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.3 ms