Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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