Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KARSQ15046 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KARSQ15046 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KARSQ15046 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KARSQ15046 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KARSQ15046 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KARSQ15046 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KARSQ15046 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KARSQ15046 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KARSQ15046 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KARSQ15046 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KARSQ15046 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KARSQ15046 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KARSQ15046 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KARSQ15046 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KARSQ15046 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KARSQ15046 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KARSQ15046 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KARSQ15046 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KARSQ15046 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KARSQ15046 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KARSQ15046 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KARSQ15046 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KARSQ15046 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KARSQ15046 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KARSQ15046 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KARSQ15046 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KARSQ15046 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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