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Protein–RNA interactions for Protein: Q14563
SEMA3A, Semaphorin-3A, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SEMA3A
Q14563
FSIP2-202
ENST00000424728
20788 nt
APPRIS P2
TSL 5
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.114-201
ENST00000363265
113 nt
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-1138P-201
ENST00000365359
106 nt
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR548A2-201
ENST00000384956
97 nt
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR934-201
ENST00000401241
83 nt
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
SNORA79-201
ENST00000408376
140 nt
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AC108752.1-201
ENST00000484679
576 nt
TSL 5
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
SNORD33.1-201
ENST00000516213
88 nt
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-781P-201
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101 nt
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNA5SP153-201
ENST00000516498
76 nt
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
CERS6-AS1-202
ENST00000594898
499 nt
TSL 5
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
C16orf97-206
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TSL 2
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR376A2-201
ENST00000636782
80 nt
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR3914-2-201
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95 nt
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
NEDD1-204
ENST00000457368
3162 nt
TSL 2
BASIC
1.89
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.52-201
ENST00000362760
96 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.120-201
ENST00000363304
110 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-112P-201
ENST00000363599
104 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.253-201
ENST00000364562
112 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-476P-201
ENST00000384726
107 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNA5SP109-201
ENST00000391010
116 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AL158147.1-201
ENST00000443970
75 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.651-201
ENST00000459380
103 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RN7SL274P-201
ENST00000492268
272 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
IGKV1-22-201
ENST00000524313
326 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AP002004.2-201
ENST00000531656
154 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AC090049.2-201
ENST00000550377
109 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AC131055.1-201
ENST00000584626
316 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AC108081.1-201
ENST00000604358
221 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
WWP1P1-201
ENST00000466609
2769 nt
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
TBL1XR1-208
ENST00000430069
7948 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
1.88
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
CXADR-202
ENST00000356275
270 nt
TSL 1 (best)
BASIC
1.87
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RN7SKP200-201
ENST00000410564
320 nt
BASIC
1.87
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-1064P-201
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104 nt
BASIC
1.87
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AL445685.2-201
ENST00000422551
342 nt
BASIC
1.87
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AL606517.2-201
ENST00000442855
241 nt
BASIC
1.87
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
OR9P1P-201
ENST00000496431
281 nt
BASIC
1.87
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AC108210.2-201
ENST00000503681
201 nt
BASIC
1.87
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.690-201
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95 nt
BASIC
1.87
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AL358944.1-201
ENST00000528537
144 nt
BASIC
1.87
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR3129-201
ENST00000581095
76 nt
BASIC
1.87
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
SNORA63D-201
ENST00000364359
132 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.265-201
ENST00000364677
108 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-1056P-201
ENST00000383996
107 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-1144P-201
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104 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
SNORD61-201
ENST00000384252
73 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AC019129.1-201
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BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNA5SP100-201
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110 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNA5SP59-201
ENST00000410922
110 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
SNRPGP10-201
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225 nt
BASIC
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□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AL049830.1-201
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425 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RPS29P11-201
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BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
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312 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.666-201
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112 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
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110 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
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502 nt
TSL 4
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
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BASIC
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□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR2681-201
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105 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
SNORA28-201
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126 nt
BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
5S_rRNA.19-201
ENST00000612131
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BASIC
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□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AL591926.4-201
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SEMA3A
Q14563
5S_rRNA.18-201
ENST00000621941
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BASIC
1.86
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-834P-201
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110 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
SNORA1B-201
ENST00000362535
133 nt
BASIC
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□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
SNORD58C-201
ENST00000365223
64 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR30A-201
ENST00000385092
71 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-440P-201
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105 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR891A-201
ENST00000401237
79 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR1289-2-201
ENST00000408360
111 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.617-201
ENST00000410920
90 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AL591806.2-201
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173 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
HMGN1P7-201
ENST00000491722
313 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RPL23AP63-201
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471 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU5E-3P-201
ENST00000515913
68 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-589P-201
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107 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.692-201
ENST00000516627
105 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU7-28P-201
ENST00000516759
62 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.714-201
ENST00000517065
90 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNU6-1270P-201
ENST00000517128
108 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AC099850.3-201
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321 nt
TSL 3
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AC008507.4-201
ENST00000585464
127 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AL365205.2-201
ENST00000594586
68 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AC022217.4-201
ENST00000604389
163 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR8054-201
ENST00000620877
86 nt
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
TDRD15-202
ENST00000622654
5805 nt
APPRIS P1
BASIC
1.85
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
LRRD1-203
ENST00000430130
2661 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
SNORD114-1-201
ENST00000362705
72 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR624-201
ENST00000385217
97 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
TRAJ2-201
ENST00000390535
66 nt
APPRIS P1
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AL603914.1-201
ENST00000401964
204 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AC018511.2-201
ENST00000413431
189 nt
TSL 3
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
AL135790.1-201
ENST00000427161
157 nt
TSL 3
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
FTH1P12-201
ENST00000432137
551 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
HSPE1P9-201
ENST00000440046
311 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RN7SKP179-201
ENST00000516126
217 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
RNA5SP236-201
ENST00000516169
116 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.709-201
ENST00000516952
92 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
MIR3122-201
ENST00000577243
73 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
JPX_2.1-201
ENST00000614161
69 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
SEMA3A
Q14563
NPPA-AS1_2.1-201
ENST00000618496
149 nt
BASIC
1.84
□□□□□ -2.11
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