Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPRL3Q12980 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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