Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1Q9UJ41 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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RABGEF1Q9UJ41 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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