Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HPF1Q9NWY4 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HPF1Q9NWY4 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HPF1Q9NWY4 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HPF1Q9NWY4 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HPF1Q9NWY4 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HPF1Q9NWY4 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HPF1Q9NWY4 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
HPF1Q9NWY4 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
HPF1Q9NWY4 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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