Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201 ms