Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LINC00336Q6ZUF6 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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