Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Q6P435 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Q6P435 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Q6P435 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Q6P435 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Q6P435 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Q6P435 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Q6P435 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Q6P435 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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