Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIDA1Q1XH10 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIDA1Q1XH10 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.9 ms