Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
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SGCAQ16586 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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SGCAQ16586 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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SGCAQ16586 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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SGCAQ16586 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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SGCAQ16586 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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SGCAQ16586 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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SGCAQ16586 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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SGCAQ16586 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCAQ16586 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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