Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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SGCBQ16585 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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SGCBQ16585 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
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SGCBQ16585 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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SGCBQ16585 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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SGCBQ16585 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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SGCBQ16585 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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