Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
DDX39BQ13838 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.5 ms