Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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