Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NPRL3Q12980 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NPRL3Q12980 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.4 ms