Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200 ms