Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RNF20Q5VTR2 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RNF20Q5VTR2 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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