Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZNF260Q3ZCT1 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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