Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNN3Q15417 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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