Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCARB2Q14108 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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