Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KLF9Q13886 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KLF9Q13886 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KLF9Q13886 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KLF9Q13886 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KLF9Q13886 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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