Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.7 ms