Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXD4Q12950 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXD4Q12950 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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