Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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