Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SGCAQ16586 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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SGCAQ16586 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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SGCAQ16586 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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SGCAQ16586 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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