Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNN3Q15417 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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