RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q14563
SEMA3A, Semaphorin-3A, human
Predictions only
Length
771 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SEMA3A
Q14563
MIR7843-201
ENST00000622274
79 nt
BASIC
2.07
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
XIRP2-201
ENST00000295237
5246 nt
TSL 2
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SNORD45.3-201
ENST00000363836
72 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.251-201
ENST00000364551
99 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-1082P-201
ENST00000364574
107 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNA5SP205-201
ENST00000364653
136 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.337-201
ENST00000365312
102 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SNORA8-201
ENST00000384574
139 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-136P-201
ENST00000384663
107 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-1228P-201
ENST00000391014
107 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNA5SP338-201
ENST00000410495
85 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RPL30P13-201
ENST00000418873
348 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
HMGN2P3-201
ENST00000433603
273 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
HMGN2P5-201
ENST00000436882
273 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
HSPE1P13-201
ENST00000451143
297 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AL021397.1-201
ENST00000451806
248 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AC116666.1-201
ENST00000453915
551 nt
TSL 5
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-717P-201
ENST00000459076
104 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-1211P-201
ENST00000459179
105 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-1333P-201
ENST00000516162
93 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU1-142P-201
ENST00000516682
145 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AC015720.1-201
ENST00000565251
277 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
MIR1273D-201
ENST00000577266
86 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
POLR3GP1-201
ENST00000594073
261 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AL353149.1-201
ENST00000610667
244 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AL359075.3-201
ENST00000613288
217 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
5S_rRNA.13-201
ENST00000622298
123 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
MIR338-201
ENST00000636369
67 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AP000553.5-201
ENST00000641933
54 nt
BASIC
2.06
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AL391516.1-201
ENST00000554380
2449 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-862P-201
ENST00000362804
105 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.127-201
ENST00000363386
109 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU1-96P-201
ENST00000364163
162 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SNORD50B-201
ENST00000364995
70 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
LINC00583-201
ENST00000381010
387 nt
TSL 2
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-144P-201
ENST00000383951
107 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-1323P-201
ENST00000384025
107 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
MIR513C-201
ENST00000401352
84 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
MIR1283-2-201
ENST00000408621
87 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNA5SP425-201
ENST00000410336
112 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-1186P-201
ENST00000410429
97 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
KRTAP25-1-201
ENST00000416044
370 nt
APPRIS P1
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
CST2P1-201
ENST00000425770
87 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AC025033.1-201
ENST00000463883
194 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU1-40P-201
ENST00000516816
164 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU1-97P-201
ENST00000516872
164 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
IGKV3-31-201
ENST00000523109
329 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AL929325.1-201
ENST00000603096
117 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AL021707.8-201
ENST00000609428
183 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
ST7-OT4_1.1-201
ENST00000615322
200 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
U1.36-201
ENST00000620684
176 nt
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SCN7A-206
ENST00000619410
7186 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SCN7A-207
ENST00000621965
7186 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
2.05
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.294-201
ENST00000364916
102 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SNORD116-14-201
ENST00000383894
92 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SNORD116-17-201
ENST00000383929
92 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SNORD116-15-201
ENST00000384445
92 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SNORD116-19-201
ENST00000384729
92 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
MIR597-201
ENST00000384968
97 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RPL23AP54-201
ENST00000495129
419 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU7-172P-201
ENST00000517125
64 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
MIR5688-201
ENST00000580619
83 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
MIR4524B-201
ENST00000581569
115 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AC120024.3-201
ENST00000603167
156 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AC005972.2-201
ENST00000604690
348 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.783-201
ENST00000613546
102 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
U6.73-201
ENST00000619194
103 nt
BASIC
2.04
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
PYGO1-201
ENST00000302000
8488 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
FSIP2-206
ENST00000611759
3882 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
U8.2-201
ENST00000363156
134 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-215P-201
ENST00000365169
102 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-728P-201
ENST00000365375
104 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-484P-201
ENST00000384016
107 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SNORD37.2-201
ENST00000391075
66 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.587-201
ENST00000391210
103 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU4-43P-201
ENST00000410628
137 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AC008267.6-201
ENST00000441664
139 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
snoU13.15-201
ENST00000459407
104 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-437P-201
ENST00000459408
95 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AL049861.1-201
ENST00000603130
150 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
AC104819.3-201
ENST00000603264
540 nt
TSL 4
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
SNRPGP19-201
ENST00000603826
189 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
uc_338.20-201
ENST00000621563
178 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
MIR219B-201
ENST00000637023
88 nt
BASIC
2.03
□□□□□ -2.08
SEMA3A
Q14563
RNU6-199P-201
ENST00000362954
107 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
RNU4-13P-201
ENST00000364019
141 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.353-201
ENST00000365440
108 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.393-201
ENST00000383936
102 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
RNU6-44P-201
ENST00000384045
107 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
RNU6-376P-201
ENST00000384731
106 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
TRAJ50-201
ENST00000390487
60 nt
APPRIS P1
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
RN7SKP101-201
ENST00000411376
320 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
ATP6V0E1P3-201
ENST00000420036
246 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
GHRL-208
ENST00000439975
326 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
RNU7-107P-201
ENST00000459121
61 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
RPL36AP21-201
ENST00000490372
323 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.686-201
ENST00000516548
134 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
AC024995.1-201
ENST00000523014
93 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
TRAV1-1-201
ENST00000542354
392 nt
APPRIS P1
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
SEMA3A
Q14563
MIR5089-201
ENST00000580047
84 nt
BASIC
2.02
□□□□□ -2.09
First
Previous
961
Next
Last
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.8 ms