Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3AQ14563 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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