Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
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TNFAIP1Q13829 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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TNFAIP1Q13829 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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TNFAIP1Q13829 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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TNFAIP1Q13829 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TNFAIP1Q13829 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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