Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIK3Q13003 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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