Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP35Q9P2H5 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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USP35Q9P2H5 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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USP35Q9P2H5 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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USP35Q9P2H5 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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