Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCAQ16586 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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