Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.9 ms