Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KARSQ15046 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KARSQ15046 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KARSQ15046 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KARSQ15046 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KARSQ15046 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KARSQ15046 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KARSQ15046 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KARSQ15046 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KARSQ15046 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KARSQ15046 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KARSQ15046 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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