Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNTA1Q13424 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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