Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms