Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SNX13Q9Y5W8 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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