Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP49Q70CQ1 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP49Q70CQ1 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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