Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF260Q3ZCT1 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.8 ms