Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRTO14522 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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