Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC39Q96DD0 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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LRRC39Q96DD0 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRRC39Q96DD0 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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