Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms