Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BBS9Q3SYG4 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BBS9Q3SYG4 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.5 ms