Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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SGCAQ16586 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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SGCAQ16586 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
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SGCAQ16586 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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SGCAQ16586 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
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SGCAQ16586 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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SGCAQ16586 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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SGCAQ16586 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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